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Beaucoup d’espèces bactériennes peuvent être observées sous forme unicellulaire isolée alors que d’autres espèces sont associées en paires comme les Neisseria ou en chaînette, caractéristique des Streptocoques. Dans ces cas, les coques se divisent selon un axe unique et les cellules restent liées après la division. Certains coques se divisent selon un axe perpendiculaire et s’agencent de façon régulière pour former des feuillets. D’autres se divisent de façon désordonnée et forment des amas comme les membres du genre Staphylococcus qui présentent un regroupement caractéristique en grappe de raisins. D’autres bactéries peuvent s’élonger et former des filaments composés de plusieurs cellules comme les actinobactéries. D’autres organismes comme les cyanobactéries forment des chaînes appelées trichomes. Dans ce cas, les cellules sont en relation étroite et les échanges physiologiques sont favorisés.
En dépit de leur apparente simplicité, les bactéries peuvent aussi former des associations complexes. Elles peuvent s’attacher aux surfaces et former des agrégations appelées biofilms. Les bactéries présentes dans le biofilm peuvent présenter un arrangement complexe de cellules et de composants extracellulaires, formant des structures secondaires comme des microcolonies, dans lesquelles se forme un réseau de canaux facilitant la diffusion des nutriments.
Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux. Le plus souvent unicellulaires, elles sont parfois pluricellulaires (généralement filamenteuses) et peuvent également former des colonies dont les cellules restent agglutinées au sein d'un gel muqueux (biofilm).
Les bactéries les plus grosses mesurent plus de 2 μm et, jusqu'au début du XXIe siècle, les spécialistes considéraient que les plus petites mesuraient 0,2 μm, mais il existe des « ultramicrobactéries », y compris en eau douce1,2,3.
Liste alphabétique de noms vulgaires ou de noms vernaculaires attestés26 en français.
- Bactérie - Bacteria27,28 ou Eubacteria28
- Bactérie vraie - voir Bactérie28
- Bactérie ammonifiante - bactérie qui participe à la dégradation des protéines en azote ammoniacal28
- Bactérie de la dysenterie porcine - Brachyspira hyodysenteriae28 (syn. Serpulina hyodysenteriae28 ou Treponema hyodysenteriae29) responsable de la dysenterie porcine
- Bactérie du rouget du porc - Erysipelothrix rhusiopathiae28, responsable du rouget du porc
- Bactérie lactique - ferment lactique28 ou plus précisément Lactobacteriacae28
- Bactérie nitreuse - Bactérie du sol qui assurent la nitrification de l'azote nitreux28
- Bactérie nitrifiante - Bactérie du sol participe à la nitrification de l'azote ammoniacal28
- Bactérie non sulfureuse verte - Chloroflexi28
- Bactérie pathogène - (cf. TLFi)
- Bactérie sporulée - bactéries pourvues de spores ou sporulales28
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En 1977, Carl Woese grâce à ses travaux de phylogénie moléculaire divisa les procaryotes en deux domaines : les Eubacteria et les Archaebacteria30 ; il les renomma respectivement Bacteria et Archaea lors de la révision de sa nomenclature en 199031. Le mot "bactérie" faisant référence à l'ensemble des procaryotes avant 1990, ce renommage a provoqué une certaine ambigüité dans l'utilisation de ce terme. Ce renommage n'a donc pas été accepté par tous les biologistes32,33,34,35,36.
Certains biologistes21,37 pensent que cette tentative de renommage tient davantage de la propagande (de la part de Carl Woese, afin d'accréditer ses idées) que de la science :
« Therefore archaebacterial cell structure, growth, division, and genetics remained fundamentally bacterial or prokaryotic. Early claims that archaebacteria are a “third form of life” in addition to eukaryotes and prokaryotes/bacteria are thus falsified, despite misleading, confusing, purely propagandistic name changes that some of us never accepted [...] »37
Et plus loin dans le même article :
« Differences between archaebacteria and eubacteria have been grossly exaggerated. »
Dans un cadre kuhnien la théorie des trois domaines qui sous-tend ce changement de nomenclature est parfois analysé comme un paradigme de la bactériologie moderne38,39,21, ce qui expliquerait les résistances (principalement de nature sociologiques) contre sa remise en cause.
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Beaucoup d’espèces bactériennes peuvent être observées sous forme unicellulaire isolée alors que d’autres espèces sont associées en paires comme les Neisseria ou en chaînette, caractéristique des Streptocoques. Dans ces cas, les coques se divisent selon un axe unique et les cellules restent liées après la division. Certains coques se divisent selon un axe perpendiculaire et s’agencent de façon régulière pour former des feuillets. D’autres se divisent de façon désordonnée et forment des amas comme les membres du genre Staphylococcus qui présentent un regroupement caractéristique en grappe de raisins. D’autres bactéries peuvent s’élonger et former des filaments composés de plusieurs cellules comme les actinobactéries. D’autres organismes comme les cyanobactéries forment des chaînes appelées trichomes. Dans ce cas, les cellules sont en relation étroite et les échanges physiologiques sont favorisés.
En dépit de leur apparente simplicité, les bactéries peuvent aussi former des associations complexes. Elles peuvent s’attacher aux surfaces et former des agrégations appelées biofilms. Les bactéries présentes dans le biofilm peuvent présenter un arrangement complexe de cellules et de composants extracellulaires, formant des structures secondaires comme des microcolonies, dans lesquelles se forme un réseau de canaux facilitant la diffusion des nutriments.